三七入药部分为其根部，主要用于出血证、淤血证。
出血证本品甘苦性温，入肝经血分，功善止血，并能散瘀，具有止血不留瘀、化瘀不伤正的特点，凡各种内外出血证均可使用，以出血兼有瘀滞者尤为适宜。治咯血、吐血、衄血、尿血、便血、崩漏等，可单用研末吞服；或配花蕊石、血余炭同用，如化血丹；治外伤出血，能止血定痛，既可内服，又可外敷。
瘀血证本品活血散瘀、消肿定痛，善治各类瘀血疼痛，止痛效佳，为伤科、外科之要药。用于跌打损伤、瘀肿疼痛，或筋伤骨折，可单用三七研末，以黄酒送服，或与制草乌、红花等配伍，如三七伤药片；治胸痹瘀阻刺痛，可单用，或与瓜萎、薤白、桂枝等配伍；治疮痈初起，疼痛不已，单用研末，米醋调涂。